宁永忠那些年，我们错过的女孩儿续
那些年，我们错过的女孩儿——菌种鉴定错误！（续）
宁永忠
那些年，有很多的错过，也许我们还并未知晓，感谢宁才子在前一期执笔为我们陈述那些年我们错过的“女孩儿”，在意犹未尽之余，这一期我们将继续前一期的话题，将会有更多的细菌知识等待着被分享！
宁永忠：那些年，我们错过的女孩儿
阳性杆菌一些阳性杆菌，会产生分支菌丝。这些菌丝有些在48hr内不表现出来，导致鉴定错误。一些阳性杆菌（如红球菌属Rhodococcus、皮杆菌属Dermabacter）革兰染色为球状，会误作革兰阳性球菌。一些弱抗酸阳性的杆菌、需氧放线菌、快生长分枝杆菌可能会错误鉴定为棒杆菌。
棒杆菌属（Corynebacterium）
白喉棒杆菌的鉴定、毒力试验有难度。研究（JClinMicrobiol.47:-.）发现，23个欧洲国家参考中心有21%错误鉴定、13%错误毒力结果。按：吓到宝宝了，太高了吧！
无枝菌酸棒杆菌（C.amycolatum）生物化学反应多变，容易误作干燥棒杆菌（C.xerosis）、纹带棒杆菌（C.striatum）或极小棒杆菌（C.minutissimum）。s之前的干燥棒杆菌（C.xerosis），几乎都是错误鉴定的无枝菌酸棒杆菌（C.amycolatum）。
混淆棒杆菌（C.confusum）菌株会误作丙酸棒杆菌（C.propinquum）。APICoryne鉴定条要孵育48hr。按：菌名即是提示。
模拟棒杆菌（C.imitans）会误作白喉棒杆菌、极小棒杆菌（C.minutissimum）。按：菌名即是提示。
马氏棒杆菌（C.matruchotii）有异质性。部分代表性菌株会误作坚硬棒杆菌（C.durum）。
多耐棒杆菌（C.resistens），常规实验室会将之会误作杰氏棒杆菌（C.Jeikeium）。
结核硬脂酸棒杆菌（C.tuberculostearicum）：会有错误鉴定（JClinMicrobiol.50:-.）。
溶血隐秘杆菌，因为临床检查适应征类似，而且有β溶血，所以有时会误作化脓链球菌。该菌感染也会和猩红热、白喉混淆（JEmergMed.9:33-35.）。
戈登菌属（Gordonia）：会被误作奴卡菌属（Nocardia）或红球菌属（Rhodococcus）（ClinInfectDis.45:-.）。
马红球菌（Rhodococcusequi）：2例菌血症（伴肺脓肿）致死——多套血培养阳性，被误作棒杆菌菌种（Clinics.62:-.）。按：这值得我们警惕——不能笼统地不加分析地视棒杆菌血液分离株为污染。实验室要准确鉴定、临床要认真分析。
迪茨菌属（Dietzia）（EurJClinMicrobiolInfectDis.31:-.）和冢村菌（Tsukamurella）（IntJAntimicrobAgents.38:-.），初始鉴定误作马红球菌。
奴卡菌属：有文章（JClinMicrobiol.48:-.）报道了质谱数据库的重要性。更新前，43株奴卡菌，仅65%到种或属水平，15(35%)株错误鉴定；更新后，95%正确鉴定。按：我们实际工作中，会有体会——放线菌、奴卡菌比较难鉴定。
单核细胞增生李斯特菌革兰染色、形态、排列都和棒杆菌类似（尤其是血培养阳性直接涂片）。
猪红斑丹毒丝菌（Erysipelothrixrhusiopathiae）会和棒杆菌、链球菌混淆。仔细观察菌体形态、触酶试验，可以区分。
分枝杆菌属（Mycobacterium）
猿猴分枝杆菌（M.simiae）：以色列研究（EmergInfectDis.14:-.）显示，囊性纤维化患者NTM分离株，40.5%是猿猴分枝杆菌，脓肿分枝杆菌（M.abscessus）31%、鸟胞内复合群（MAC）14.3%。如果不进行色素检测，没有经验的观察者会将之误作结核分枝杆菌。
志贺分枝杆菌（M.shigaense）：该菌有独特的hsp65和rpoB基因、独特的ITS区域。如果仅仅根据16SrRNA基因序列，则会误作猿猴分枝杆菌（M.simiae）（JDermatol.39:-.）。
亚洲分枝杆菌（M.asiaticum）：24株传统方法鉴定为龟分枝杆菌（M.chelonae）或脓肿分枝杆菌，用pyrosequencinganalysis得以正确鉴定（JClinMicrobiol.48:-.）。
阴性菌肠杆菌科
有文章（EurJClinMicrobiolInfectDis.32:-.）报道，质谱（MALDI-TOFMS）鉴定肠杆菌科细菌株，代表17个属、40个种。与参考方法一致率96.7%。83.8%正确到种，12.8%限于属。7株属错误，3株聚团泛菌误作肠杆菌属，1株生癌肠杆菌（Enterobactercancerogenus）误作产酸克雷伯菌（Klebsiellaoxytoca），1株赫氏埃希菌（Escherichiahermannii）误作克氏柠檬酸杆菌（Citrobacterkoseri），1株蜂房哈夫尼菌（Hafniaalvei）误作Obesumbacteriumproteus，1株解鸟氨酸拉乌尔菌（Raoultellaornithinolytica）误作产气肠杆菌。8株种错误。阴沟肠杆菌复合群内不同种，可以用质谱进行区分；植生拉乌尔菌（Raoultellaplanticola）、解鸟氨酸拉乌尔菌和产酸克雷伯菌的谱型相似。
埃希菌属：
有文章（JClinMicrobiol.41:-.）报道，阿尔伯蒂埃希菌（Escherichiaalbertii）会被商品化鉴定系统误作蜂房哈夫尼菌、沙门菌、大肠埃希菌、鲁氏耶尔森菌（Yersiniaruckeri）（鱼类病原）。
沙门菌属：
商业化鉴定系统会错误鉴定该属菌种（JClinMicrobiol.44:-.）。副伤寒A因为表型独特（H2S-、赖氨酸-、柠檬酸-），也容易误作大肠埃希菌。
志贺菌属：
不同的生物化学类商品化鉴定系统准确率仅仅50%-70%（JClinMicrobiol.44:-.）。质谱也不好，会误作大肠埃希菌（JClinMicrobiol.48:-2.JClinMicrobiol.50:-.）。
普罗威登斯菌属：
商品化鉴定系统的准确率在79%-%（JClinMicrobiol.48:-2.），会被误作摩根菌属、变形杆菌属。P.stuartii会被误作P.rettgeri。
摩根摩根菌：2小时快速鉴定系统，66%会鉴定错误。
达尔豪斯艾弗里菌（Averyelladalhousiensis）：大家认识吗？我也只知道，是肠杆菌科成员。商品化鉴定系统数据库不包括该菌，会被误作抗坏血酸克吕沃尔菌（Kluyveraascorbata）或肠沙门菌。
非共生光杆状菌（Photorhabdusasymbiotica）：也是肠杆菌科。多数商品化鉴定系统数据库不包括该菌。
鼠疫耶尔森菌：不建议采用自动化生物化学系统，因为数据库一般不包括该菌。有研究（ClinInfectDis.55:58-60.）报道，2个分离株在多个自动化系统都出现鉴定错误，误作洛菲不动杆菌（MicroScan）、浅黄假单胞菌（Pseudomonasluteola）和假结核耶尔森菌（Vitek-2）、假结核耶尔森菌（Phoenix）。患者出现疾病表现后，2-4周没有确诊。
气单胞菌属：
水族馆气单胞菌（Aeromonasaquariorum）在年引起一场争议，因为其表型、基因型与嗜水气单胞菌达卡亚种（A.hydrophilasubsp.dhakensis）相同。后来二者合并为达卡气单胞菌（A.dhakensis,sp.nov.,白癜风怎么看好怎么样治疗白癜风好呢